清除菌源。早春苹果树萌芽前，彻底清除果园周边桧柏等转主寄主上的锈病菌瘿；雨后及时喷施3—5波美度石硫合剂或三唑酮，彻底杀灭越冬菌源。
　　树上喷药防控。苹果树花芽露红时喷施第一次药剂，落花后喷施第二次；发病严重的果园，落花后10—15天需补喷第三次。常用药剂：15%三唑酮可湿性粉剂1500—2000倍液、12%烯唑醇可湿性粉剂2000—2500倍液等。
　　新建果园规避风险。新建果园需远离桧柏、龙柏、翠柏等锈病转主寄主集中的景区、公路、陵园等区域，确保果园方圆5千米内无上述柏类树木。